Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syt1P46096 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syt1P46096 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syt1P46096 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syt1P46096 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syt1P46096 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syt1P46096 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Syt1P46096 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Syt1P46096 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syt1P46096 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syt1P46096 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syt1P46096 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms