Protein–RNA interactions for Protein: P32972

Tnfsf8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf8P32972 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf8P32972 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf8P32972 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms