Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gsx2P31316 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gsx2P31316 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms