Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hoxd10P28359 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd10P28359 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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