Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NdnP25233 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NdnP25233 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NdnP25233 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NdnP25233 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NdnP25233 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NdnP25233 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NdnP25233 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NdnP25233 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NdnP25233 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NdnP25233 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NdnP25233 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NdnP25233 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NdnP25233 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NdnP25233 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NdnP25233 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NdnP25233 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NdnP25233 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NdnP25233 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NdnP25233 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NdnP25233 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NdnP25233 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NdnP25233 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NdnP25233 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NdnP25233 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NdnP25233 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NdnP25233 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NdnP25233 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NdnP25233 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NdnP25233 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NdnP25233 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NdnP25233 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NdnP25233 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms