Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30aP15533 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim30aP15533 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms