Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Defa1P11477 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Defa1P11477 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Defa1P11477 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa1P11477 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa1P11477 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defa1P11477 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.1 ms