Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Col1a1P11087 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms