Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM228BP0C875 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM228BP0C875 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms