Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna6P07350 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms