Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt1P04104 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt1P04104 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt1P04104 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt1P04104 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt1P04104 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt1P04104 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms