Protein–RNA interactions for Protein: P01792

Ig heavy chain V region HPCG8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01792 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01792 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01792 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01792 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01792 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01792 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01792 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01792 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01792 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01792 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01792 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01792 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01792 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01792 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01792 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01792 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01792 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01792 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01792 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01792 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01792 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01792 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01792 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01792 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01792 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01792 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01792 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01792 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01792 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01792 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01792 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01792 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01792 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01792 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01792 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01792 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01792 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01792 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01792 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01792 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01792 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01792 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01792 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01792 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01792 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01792 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01792 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01792 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01792 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01792 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01792 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01792 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01792 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01792 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01792 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01792 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01792 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01792 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01792 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01792 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01792 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01792 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01792 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01792 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms