Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01728 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01728 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01728 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01728 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01728 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01728 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01728 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01728 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01728 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01728 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01728 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01728 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01728 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01728 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01728 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01728 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01728 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01728 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01728 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01728 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01728 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01728 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01728 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01728 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01728 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01728 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P01728 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01728 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01728 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01728 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01728 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01728 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01728 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01728 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01728 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01728 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01728 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01728 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01728 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01728 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01728 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01728 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01728 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01728 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01728 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01728 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01728 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01728 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01728 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01728 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01728 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms