Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CopeO89079 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopeO89079 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopeO89079 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CopeO89079 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CopeO89079 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CopeO89079 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CopeO89079 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CopeO89079 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CopeO89079 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CopeO89079 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CopeO89079 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopeO89079 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopeO89079 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopeO89079 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopeO89079 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CopeO89079 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CopeO89079 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CopeO89079 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CopeO89079 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CopeO89079 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CopeO89079 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CopeO89079 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CopeO89079 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopeO89079 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopeO89079 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopeO89079 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopeO89079 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopeO89079 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopeO89079 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopeO89079 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopeO89079 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CopeO89079 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopeO89079 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopeO89079 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopeO89079 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CopeO89079 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CopeO89079 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CopeO89079 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CopeO89079 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CopeO89079 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CopeO89079 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CopeO89079 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CopeO89079 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CopeO89079 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CopeO89079 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CopeO89079 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CopeO89079 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CopeO89079 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopeO89079 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopeO89079 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopeO89079 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopeO89079 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopeO89079 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopeO89079 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopeO89079 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopeO89079 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopeO89079 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopeO89079 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CopeO89079 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopeO89079 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopeO89079 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopeO89079 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopeO89079 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopeO89079 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopeO89079 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopeO89079 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CopeO89079 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopeO89079 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopeO89079 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopeO89079 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopeO89079 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopeO89079 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopeO89079 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CopeO89079 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopeO89079 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopeO89079 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopeO89079 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopeO89079 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CopeO89079 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopeO89079 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopeO89079 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopeO89079 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopeO89079 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CopeO89079 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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