Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme6O88425 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme6O88425 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme6O88425 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme6O88425 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme6O88425 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme6O88425 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nme6O88425 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme6O88425 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms