Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Supt5hO55201 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Supt5hO55201 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms