Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm44O35857 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Timm44O35857 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Timm44O35857 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Timm44O35857 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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Timm44O35857 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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Timm44O35857 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Timm44O35857 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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Timm44O35857 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Timm44O35857 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Timm44O35857 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Timm44O35857 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Timm44O35857 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Timm44O35857 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Timm44O35857 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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