Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Degs1O09005 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Degs1O09005 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Degs1O09005 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Degs1O09005 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Degs1O09005 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Degs1O09005 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Degs1O09005 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Degs1O09005 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Degs1O09005 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Degs1O09005 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Degs1O09005 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Degs1O09005 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Degs1O09005 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Degs1O09005 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Degs1O09005 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Degs1O09005 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Degs1O09005 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Degs1O09005 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Degs1O09005 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Degs1O09005 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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