Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
7530416G11RikJ3QJX6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
7530416G11RikJ3QJX6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
7530416G11RikJ3QJX6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms