Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp9yF8VPU6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp9yF8VPU6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms