Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5218F6YH22 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5218F6YH22 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms