Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q5

1700113H08Rik, RIKEN cDNA 1700113H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700113H08RikE9Q9Q5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700113H08RikE9Q9Q5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700113H08RikE9Q9Q5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700113H08RikE9Q9Q5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms