Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdhr2E9Q7P9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdhr2E9Q7P9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms