Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ApobE9Q414 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms