Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r238E9Q373 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms