Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3250E9Q1M3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms