Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim30dE9PWL0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim30dE9PWL0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms