Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FgaE9PV24 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FgaE9PV24 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms