Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ldlrad1D3YYZ1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldlrad1D3YYZ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms