Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo5D3YW29 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo5D3YW29 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo5D3YW29 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms