Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtcflA2APF3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtcflA2APF3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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