Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc183A2AJB1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc183A2AJB1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc183A2AJB1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms