Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ckap5A2AGT5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap5A2AGT5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms