Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

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Length 842 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms