Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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