Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W3

Ighv1-53, Immunoglobulin heavy variable 1-53 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-53A0A075B5W3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ighv1-53A0A075B5W3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ighv1-53A0A075B5W3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ighv1-53A0A075B5W3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ighv1-53A0A075B5W3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ighv1-53A0A075B5W3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ighv1-53A0A075B5W3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ighv1-53A0A075B5W3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ighv1-53A0A075B5W3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ighv1-53A0A075B5W3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ighv1-53A0A075B5W3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ighv1-53A0A075B5W3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ighv1-53A0A075B5W3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ighv1-53A0A075B5W3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ighv1-53A0A075B5W3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ighv1-53A0A075B5W3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ighv1-53A0A075B5W3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ighv1-53A0A075B5W3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ighv1-53A0A075B5W3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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