Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Fxyd5-201ENSMUST00000009831 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Piwil4-201ENSMUST00000076946 2637 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 1700108F19Rik-205ENSMUST00000190818 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Olfr914-202ENSMUST00000217057 4948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Hdhd2-201ENSMUST00000026485 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Sncaip-210ENSMUST00000179689 1512 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm1123-201ENSMUST00000076730 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm438-201ENSMUST00000105746 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm11399-201ENSMUST00000131021 324 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm44790-201ENSMUST00000204137 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm18641-201ENSMUST00000211763 1246 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Rps25-204ENSMUST00000216076 393 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 CT033781.3-201ENSMUST00000221886 504 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 AC134869.4-201ENSMUST00000224724 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Olfr237-ps1-201ENSMUST00000095953 1000 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 1700126A01Rik-201ENSMUST00000185283 2061 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Vwa3b-206ENSMUST00000169057 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Klhl10-201ENSMUST00000001599 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm3286-201ENSMUST00000171752 1316 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm13254-201ENSMUST00000118295 654 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Sla-204ENSMUST00000168522 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Ngf-204ENSMUST00000198644 1120 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Olfr685-201ENSMUST00000051355 1088 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Katnal2-201ENSMUST00000026486 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Dclre1c-203ENSMUST00000102988 2469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Ift122-201ENSMUST00000038234 4056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 4921515L22Rik-201ENSMUST00000218993 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm36752-201ENSMUST00000220527 1546 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Coa4-202ENSMUST00000120454 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm13832-201ENSMUST00000146546 414 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm8964-201ENSMUST00000165944 805 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm21013-201ENSMUST00000184952 1201 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm37350-201ENSMUST00000192782 313 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Olfr209-203ENSMUST00000208875 1194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Rps12-201ENSMUST00000073926 490 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm25129-201ENSMUST00000082651 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Rarres2-201ENSMUST00000009425 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm12475-201ENSMUST00000119476 1389 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Dusp18-202ENSMUST00000109996 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Pxylp1-202ENSMUST00000112951 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Rrm2-201ENSMUST00000020980 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Cabyr-202ENSMUST00000115857 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 L3mbtl3-203ENSMUST00000174766 3411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gm4798-201ENSMUST00000218024 1699 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Pwp1-201ENSMUST00000001836 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin2bQ01097 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms