Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd2Q9Z2E1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms