Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rlbp1Q9Z275 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rlbp1Q9Z275 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.7 ms