Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP16Q9Y5T5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP16Q9Y5T5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms