Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Slit3Q9WVB4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Slit3Q9WVB4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slit3Q9WVB4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms