Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcsQ9WU84 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms