Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO4Q9UKT5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO4Q9UKT5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms