Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zeb2Q9R0G7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms