Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms