Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptf1aQ9QX98 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptf1aQ9QX98 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptf1aQ9QX98 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptf1aQ9QX98 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptf1aQ9QX98 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptf1aQ9QX98 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptf1aQ9QX98 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptf1aQ9QX98 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptf1aQ9QX98 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptf1aQ9QX98 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms