Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWK4

Cd5l, CD5 antigen-like, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5lQ9QWK4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd5lQ9QWK4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd5lQ9QWK4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms