Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM0

Itga2b, Integrin alpha-IIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga2bQ9QUM0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga2bQ9QUM0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itga2bQ9QUM0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga2bQ9QUM0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms