Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEC31BQ9NQW1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC31BQ9NQW1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms