Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cul3Q9JLV5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms